环氧乙烷由于是一种化学气体，或多或少都会对灭菌的产品造成污染，因此出口国外的产品都不允许用环氧乙烷灭菌，甚至有人认为环氧乙烷是一种不负责任的灭菌方式，尤其是在中国，有多少厂家会建立专门的尾气处理装置呢？
相对环氧乙烷灭菌，辐照灭菌是无污染、无残留的灭菌方式，尤其是电子束灭菌，电子束由高能电子加速器产生，本身不含有放射源，相对钴60更安全，从灭菌剂量上来说，电子加速器提供的剂量更准确，也是今后辐照灭菌的发展方向。
环氧乙烷是广谱、高效的气体杀菌消毒剂。对消毒物品的穿透力强，可达到物品深部，可以杀灭数病原微生物，包括细菌繁殖体、芽孢、病毒和真菌。气体和液体均有较强杀微生物作用，以气体作用强，故多用其气体。在医学消毒和工业灭菌上用途广泛。
综上所述，辐照灭菌将成为未来的主要灭菌方式，无论从环保、安全、可靠的角度看都远胜于环氧乙烷灭菌。
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