环氧乙烷灭菌是一个无菌产品的生产过程之一，其目的在于确保无菌包装的产品在经过一个灭菌过程后，产品上存活的微生物均被杀灭。 同时，产品本身以及保护产品的灭菌包装--无菌屏障应没有损坏。当然放置产品的运输箱也应该没有被破坏，标签应该没有模糊。也就是说，只有微生物被杀灭了，其余的性质必须仍然维持原先的状态。
需要注意的是，一个经过确认的灭菌过程不一定会产生一个合格的结果，产品无菌还和产品本身的很多因素有关，只有这些因素都得到有效控制，才能确保最终灭菌的产品满足标准要求。
在选择灭菌供方之前，需要确定最佳的灭菌方式。常见的灭菌方式有环氧乙烷，伽马射线辐照，电子束，高压蒸汽。选择作为灭菌方式需要考虑到产品和包装：1）产品耐受温度的能力；2）产品耐受湿度的能力；3）产品结构是否适合于气体通过；4）产品包装是否适合于气体通过。
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